Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AMPD1P23109 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMPD1P23109 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms