Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms