Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF3P18847 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF3P18847 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF3P18847 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF3P18847 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATF3P18847 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF3P18847 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATF3P18847 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATF3P18847 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATF3P18847 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms