Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DESP17661 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DESP17661 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DESP17661 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DESP17661 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DESP17661 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DESP17661 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DESP17661 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DESP17661 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DESP17661 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms