Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXB4P17483 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXB4P17483 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms