Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA1P17302 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA1P17302 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GJA1P17302 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJA1P17302 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms