Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPBP14678 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPBP14678 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms