Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXB3P14651 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms