Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms