Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms