Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKBP12277 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKBP12277 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKBP12277 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKBP12277 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKBP12277 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKBP12277 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKBP12277 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms