Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F5P12259 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F5P12259 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F5P12259 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F5P12259 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F5P12259 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F5P12259 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F5P12259 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
F5P12259 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
F5P12259 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms