Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSB-PGBD3P0DP91 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSB-PGBD3P0DP91 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms