Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIL1P09327 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIL1P09327 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIL1P09327 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIL1P09327 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIL1P09327 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms