Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP10P09238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP10P09238 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MMP10P09238 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MMP10P09238 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MMP10P09238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP10P09238 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP10P09238 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MMP10P09238 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MMP10P09238 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms