Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RB1P06400 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RB1P06400 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RB1P06400 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RB1P06400 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RB1P06400 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RB1P06400 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RB1P06400 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RB1P06400 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RB1P06400 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RB1P06400 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RB1P06400 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms