Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCCAP05165 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCCAP05165 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCCAP05165 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCCAP05165 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCCAP05165 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCCAP05165 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCCAP05165 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCCAP05165 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms