Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOC1P02654 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOC1P02654 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms