Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFT2D2O95562 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D2O95562 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms