Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB6O95452 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB6O95452 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJB6O95452 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJB6O95452 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB6O95452 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms