Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP3O75154 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP3O75154 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms