Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8AO60658 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE8AO60658 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms