Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL4O60488 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSL4O60488 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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