Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNA2O43921 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms