Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX6O43752 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX6O43752 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX6O43752 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX6O43752 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX6O43752 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX6O43752 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX6O43752 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX6O43752 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX6O43752 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms