Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH3O43739 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms