Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRC1O43663 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRC1O43663 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRC1O43663 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRC1O43663 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRC1O43663 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRC1O43663 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRC1O43663 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms