Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYN3O14994 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYN3O14994 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYN3O14994 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms