Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms