Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PES1O00541 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PES1O00541 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PES1O00541 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PES1O00541 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PES1O00541 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PES1O00541 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PES1O00541 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms