Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
E9PCH4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
E9PCH4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E9PCH4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
E9PCH4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
E9PCH4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
E9PCH4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
E9PCH4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
E9PCH4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
E9PCH4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
E9PCH4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
E9PCH4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E9PCH4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms