Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOBPA7XYQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOBPA7XYQ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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