Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP27XA6NNY8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP27XA6NNY8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms