Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLL13PA6NNM8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL13PA6NNM8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms