Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C5orf51A6NDU8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms