Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD3A2A2Y4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms