Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE3A1L190 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE3A1L190 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms