Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 IGSF1-201ENST00000361420 4378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GSDMC-204ENST00000619643 1831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GABRB3-201ENST00000299267 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TCEANC2-203ENST00000391366 1783 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PPP1R10P1-201ENST00000531876 1795 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL022069.2-201ENST00000623222 1785 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 COA7-201ENST00000371538 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRPM3-207ENST00000377101 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FYN-229ENST00000538466 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IL24-201ENST00000294984 1701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NR2F1-AS1-202ENST00000504474 2868 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRIM39-203ENST00000396547 3187 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SPATA31E2P-201ENST00000554414 4965 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 H3F3AP6-201ENST00000230495 411 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NDUFS4-201ENST00000296684 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FAM104B-201ENST00000332132 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SNORA64.2-201ENST00000362696 132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 H3F3AP4-201ENST00000369387 411 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGHV3-38-201ENST00000390618 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GAPDHP64-201ENST00000419696 1003 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL139184.1-201ENST00000426579 364 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL022324.1-201ENST00000433457 663 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PSAT1P3-201ENST00000439132 1111 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CASP12-205ENST00000441710 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP000290.1-201ENST00000450830 449 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RPSAP18-201ENST00000453374 886 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC011447.1-201ENST00000497576 441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NR1I3-220ENST00000505005 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LINC01021-205ENST00000514255 545 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC021860.1-201ENST00000515436 376 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC116914.1-201ENST00000575043 398 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC091027.2-201ENST00000578030 179 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZNF793-AS1-204ENST00000588845 545 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NDUFA6-AS1-216ENST00000621190 766 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL139220.2-209ENST00000626342 826 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC38A4-202ENST00000447411 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRPV3-205ENST00000572519 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 EFCAB13-203ENST00000517484 3466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC4A4-205ENST00000512686 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SERAC1-205ENST00000607000 2284 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KLHL6-201ENST00000341319 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 THBS3-203ENST00000457183 2727 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP001324.3-201ENST00000624759 1428 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NLRP12-204ENST00000391773 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC6A12-202ENST00000397296 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SALL2-201ENST00000450879 3178 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IL19-202ENST00000340758 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RMRP-202ENST00000363046 264 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SPACA3-203ENST00000394638 508 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL136226.1-201ENST00000401715 802 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CYP3A43-206ENST00000417625 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGFL2-202ENST00000434646 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SNHG14-204ENST00000441592 608 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC107613.1-201ENST00000450488 1018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL356276.1-201ENST00000453692 758 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC016820.1-201ENST00000455498 579 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SL294P-201ENST00000477271 295 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP000873.2-208ENST00000500634 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC134698.2-201ENST00000519172 311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MAFA-AS1-201ENST00000519762 417 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC120042.1-201ENST00000524309 550 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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