Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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