Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A4Q9Y6R1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms