Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPRBQ9Y5M8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRBQ9Y5M8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms