Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BTRCQ9Y297 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BTRCQ9Y297 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms