Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIGD1AQ9Y241 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD1AQ9Y241 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms