Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNQ9UQP3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms