Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNND2Q9UQB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms