Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC12A4Q9UP95 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms