Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNPO2Q9UMS6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNPO2Q9UMS6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms