Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSEQ9UL01 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms