Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL6Q9UKU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms