Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms